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giovedì 9 aprile 2020

VIRUS LETALE 2: ORIGINS

È CERTO che il nuovo coronavirus COVID-19 sia passato agli umani da un ospite intermedio? Alcuni scienziati sostengono che l'incidente in laboratorio non può essere escluso...




















In due laboratori di Wuhan, esperimenti a lungo termine con virus dei pipistrelli hanno aiutato gli scienziati a identificare il nuovo coronavirus come probabilmente proveniente dal mammifero notturno, ma quegli stessi laboratori hanno anche alimentato preoccupazioni sulla biosicurezza.






La pratica della raccolta di virus dai pipistrelli in laboratorio è venuta alla luce nelle prime settimane seguite allo scoppio ell'epidemia, quando Shi Zhengli, una nota scienziata del Wuhan Institute of Virology, ha confutato un vortice di accuse online sia in patria che all'estero secondo cui il Covid-19 sarebbe "fuggito" dal suo istituto, dove un laboratorio certificato BSL-4, il livello più alto per la gestione di agenti patogeni pericolosi, è stato aperto tre anni fa.


Vi sono alcuni scienziati, sia in Cina che altrove, che sostengono che "la spiegazione accidentale "rimane una possibilità", dal momento che non ci sono ancora prove per confutarla.

"Non c'è nulla di falso o cospiratorio negli incidenti di laboratorio", ha affermato Richard Ebright, biologo molecolare e direttore del Waksman Institute of Microbiology presso la Rutgers University nel New Jersey, negli Stati Uniti, "semplicemente, accadono".
In Cina, la ricerca sui virus dei pipistrelli è iniziata poco dopo la scomparsa dell'epidemia di SARS.

Quindi, negli ultimi 10 anni, Shi e altri virologi di Wuhan hanno fatto numerose spedizioni per raccogliere virus da diverse specie di pipistrelli, costruendo la più grande banca di virus dell'Asia, secondo la newsletter dell'istituto.

Per aumentare il suo prestigio, l'istituto di Wuhan ha cercato competenze straniere per la creazione del primo laboratorio cinese BSL-4. In collaborazione con il laboratorio Jean Merieux di Lione, in Francia, all'inizio del 2017 l'istituto aveva messo su un laboratorio di 3000 metri quadrati certificato dalle autorità cinesi e francesi.


"Attraverso il lavoro sui pipistrelli, hanno trovato un'enorme varietà di virus simili alla SARS nei pipistrelli e hanno segnalato alcuni di questi virus che potrebbero avere un impatto sulla salute umana", ha affermato Leo Poon, un virologo dell'Università di Hong Kong co-autore di un documento con Shi nel 2010.


Il laboratorio BSL-4 non è l'unico laboratorio in una città di 11 milioni di persone che stava raccogliendo virus da pipistrelli.

Il laboratorio del CDC si trova a 180 metri dal mercato dei frutti di mare e dall'altra parte della strada rispetto all'ospedale dove sono arrivati i primi casi COVID-19.

Dopo lo scoppio iniziale, il virus SARS è fuoriuscito dai laboratori di Singapore e Taipei, oltre che due volte a Pechino.

Lo scorso dicembre, una perdita del batterio Brucella da un laboratorio veterinario nella provincia di Gansu ha infettato più di 100 persone.

La SARS e altri coronavirus non sono considerati sospesi nell'aria o letali, pertanto gli esperimenti su di essi sono consentiti in laboratori di livello di sicurezza inferiore, dove non sono necessarie tute complete e decontaminazione completa per i tecnici. Chiunque gestisce il virus può diventare un vettore inconsapevole.

Gli scienziati che sono scettici sull'ipotesi della fuoriuscita dal laboratorio credono che un ospite intermedio ha permesso al virus di fare il salto verso l'uomo, come per la SARS del 2003.

Il COVID-19 ha una somiglianza così stretta con il coronavirus SARS che è stato ufficialmente chiamato SARS-CoV-2.

Tuttavia, Shi e i suoi collaboratori americani hanno dimostrato che in un ambiente di laboratorio i coronavirus da pipistrello possono saltare direttamente agli umani.

Anche se il blocco a Wuhan e nella circostante provincia di Hubei è stato alleggerito nei giorni scorsi, è probabile che la ricerca dell'ospite intermediario si rivelerà difficile.

Gli animali selvatici che si credeva fossero in vendita illegalmente nel mercato del pesce - che gli scienziati vedono come esemplari - sono stati eliminati dopo che è stato chiuso all'inizio di gennaio subito dopo l'emergere del primo gruppo noto di casi. L'intera area è stata disinfettata e lavata.

Un articolo pubblicato su Nature alla fine di marzo afferma che gli scienziati cinesi hanno scoperto genomi del nuovo coronavirus dall'85,5 al 92,4 percento simili alla SARS-CoV-2 nei pangolini selvatici introdotti clandestinamente in Cina dalla Malesia nel 2017. 

La somiglianza suggerisce che il pangolino è un probabile intermediario ma non vi è una prova definitiva.



Il Daily Mail ha rivelato che i ministri britannici temono che una fuga da un laboratorio cinese possa aver causato la pandemia di coronavirus.


Ci sono state segnalazioni non verificate secondo cui i lavoratori dell'istituto sono stati prima infettati dopo essere stati spruzzati dal sangue, quindi hanno diffuso il virus nella popolazione locale.


Due microbiologi australiani, John S. Mackenzie e David W. Smith, sono scettici sul fatto che il COVID-19 sia balzato sugli umani attraverso i pangolini.


Lo studio dei dati genomici suggerisce che il ceppo del virus trovato al mercato si è evoluto da altri ceppi trovati altrove, non viceversa.

"Si stima che la dimensione della popolazione della SARS-CoV-2 abbia subito una recente espansione il 6 gennaio 2020 e una rapida espansione l'8 dicembre 2019.

Qualcuno potrebbe avere incontrato o mangiato un pangolino altrove a Wuhan lontano dall'Huanan Seafood Market, avere contratto il SARS-CoV-2, aver viaggiato per la città infettando altri, poi essere andato al mercato e aver provocato l'epidemia più grande?

Eppure una simile sequenza di eventi è già accaduta in Cina 16 anni fa.


L'epidemia SARS è iniziata quando due lavoratori del laboratorio CDC, indipendentemente l'uno dall'altro, hanno manifestato i sintomi. La fonte più probabile della loro infezione è un lotto di virus SARS apparentemente inattivo che è stato portato da una struttura ad alto contenimento in un laboratorio di ricerca a bassa sicurezza in cui i due stavano lavorando. 

Apparentemente, il processo di inattivazione - l'aggiunta di una miscela di detergenti al virus - non ha funzionato correttamente. In violazione delle normali procedure di sicurezza, il ricercatore che ha effettuato l'inattivazione, identificato solo con un cognome, "Ren", non ha verificato se il virus fosse veramente inattivo".




Ricercatori di Cambridge, Regno Unito e Germania hanno ricostruito i primi "percorsi evolutivi" di COVID-19 negli esseri umani.

Analizzando i primi 160 genomi virali completi sequenziati da pazienti umani, gli scienziati hanno mappato parte della diffusione originale del nuovo coronavirus attraverso le sue mutazioni.

"Ci sono troppe mutazioni rapide per rintracciare ordinatamente un albero genealogico COVID-19. Abbiamo usato un algoritmo di rete matematico per visualizzare contemporaneamente tutti gli alberi plausibili", ha detto il genetista.

"Queste tecniche sono per lo più note per mappare i movimenti delle popolazioni umane preistoriche attraverso il DNA. Pensiamo che questa sia la prima volta che sono state usate per tracciare le vie di infezione di un coronavirus come COVID-19."

Il team ha utilizzato i dati dei genomi dei virus campionati da tutto il mondo tra il 24 dicembre 2019 e il 4 marzo 2020.

Versioni mutate di "A" sono state osservate negli americani che avevano vissuto a Wuhan e un gran numero di virus di tipo A è stato trovato in pazienti provenienti dagli Stati Uniti e dall'Australia.


La nuova analisi suggerisce inoltre che una delle prime introduzioni del virus in Italia è avvenuta tramite la prima infezione tedesca documentata il 27 gennaio e che un'altra prima via di infezione italiana era correlata a un "cluster di Singapore".

I ricercatori affermano che le loro tecniche di rete hanno tracciato accuratamente le vie di infezione stabilite: le mutazioni e i lignaggi virali hanno unito i punti tra i casi noti.

Pertanto, gli scienziati sostengono che questi metodi "filogenetici" potrebbero essere applicati all'ultimo sequenziamento del genoma del coronavirus per aiutare a prevedere i futuri punti caldi globali della trasmissione e dell'impennata della malattia.

Il software utilizzato nello studio, nonché le classificazioni per oltre 1.000 genomi e conteggio del coronavirus, sono disponibili gratuitamente.
La variante "A", più strettamente correlata al virus trovato sia nei pipistrelli che nei pangolini, è descritta dai ricercatori come "la radice dell'epidemia"



Forster sostiene che c'è un'altra spiegazione che vale la pena considerare. "Il virus di tipo B di Wuhan potrebbe essere adattato immunologicamente o ecologicamente a una vasta parte della popolazione dell'Asia orientale. Potrebbe essere necessario mutare per superare la resistenza al di fuori dell'Asia orientale. Sembra che assistiamo a un tasso di mutazione più lento in Asia orientale che altrove, in questa fase iniziale ".


Da quando è stato condotto lo studio PNAS di oggi, il team di ricerca ha esteso la sua analisi a 1.001 genomi virali. 

I metodi di rete filogenetica utilizzati dai ricercatori - che consentono la visualizzazione simultanea di centinaia di alberi evolutivi in ​​un unico grafico - sono stati introdotti in Nuova Zelanda nel 1979, poi sviluppati dai matematici tedeschi negli anni '90.


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